INSTITUTO DE PESQUISAS ENERGÉTICAS E NUCLEARES
Repositório Digital da Produção Técnico Científica

Bioquímica estrutural da tireotrofina de Arapaima gigas e sua expressão em células de mamífero

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dc.contributor.advisor Carlos Roberto Jorge Soares pt_BR
dc.date 2022 pt_BR
dc.date.accessioned 2023-01-05T18:41:06Z
dc.date.available 2023-01-05T18:41:06Z
dc.identifier.uri http://repositorio.ipen.br/handle/123456789/33609
dc.description.abstract Introdução: O Pirarucu (Arapaima gigas) é uma espécie de peixe nativa da bacia amazônica que pode alcançar até 200 kg e dois metros de comprimento. Alvo de pesca predatória e modificações ambientais, especialmente político-econômicas, já se nota um relativo declínio da população local e, segundo órgãos fiscalizadores, a espécie está em possível risco de extinção. Há ainda uma dificuldade no manejo em cativeiro, visto sua gama de necessidades nutricionais e comportamentos que ainda são investigados. A tireotrofina (TSH) atua no controle da reprodução em diferentes espécies de peixes. E do ponto de vista ecológico tem sua expressão modificada quando em contato com substâncias poluentes, como metais pesados e agrotóxicos. O TSH é uma glicoproteína de peso molecular variando de 24-28 kDa formada pela ligação não-covalente de duas subunidades alfa e beta, sendo a alfa comum para outros hormônios glicoproteicos, como o FSH, LH e CG. Sua função é bem estabelecida, participando diretamente na síntese dos hormônios tireoidianos (HTs) que atuam no desenvolvimento embrionário, modulação da atividade cerebral, gonadal, hepática, entre outros. Objetivos: Obter a subunidade beta do TSH de Arapaima gigas, caracterizar sua estrutura in silico e expressar em células de mamífero. Metodologia: Foram utilizadas metodologias de identificação genômica da subunidade beta in silico e construção da estrutura do heterodímero com técnicas de inteligência artificial. Aplicou-se duas ferramentas de predição: gênica (Gnomon) e estrutural (Alphafold), como também se realizou in silico estudos sobre distância evolutiva, dinâmica molecular e propriedades físico-químicas. As informações recuperadas das predições foram em parte confirmadas com PCR de hipófises retiradas de Pirarucus e a expressão de agTSH em células de mamífero HEK293F. Resultados: A similaridade da cadeia beta variou de 40,10-81,60% entre 39 espécies alinhadas com a sequência obtida. São 146 aminoácidos com 12 cisteínas (que formam seis pontes dissulfeto) e um único sítio de N-glicosilação conservados. A árvore filogenética construída indica maior grau de parentesco com a ordem elopiformes e clupeiformes. A estrutura do heterodímero é majoritariamente polar, com predominância de folhas-beta na sua estrutura secundária, sendo uma citocina com nó de cistina (CATH 2.10.90.10). Os estudos de dinâmica molecular da interação do TSH com receptor do seu ancestral comum, Aruanã-dourado (S. formosus), ambos resolvidos por Alphafold, apontam valores comparáveis ao modelo humano, com diferença de valores relacionados a energia de ligação (ΔG) entre 1,50-8,64%, indicando um caminho para estudos in vitro e in vivo. Sua expressão, feita de maneira transiente, obteve rendimento de agTSH 25 mg/L, similar a trabalho anterior com agFSH 28 mg/L, quantificados através de técnicas cromatográficas no meio condicionado. Conclusões: A região codificante e 3' não traduzida da subunidade beta foi identificada e utilizada juntamente com a subunidade alfa para a produção de agTSH em células HEK293. A metodologia utilizada poderá ser aplicada para que novas proteínas da espécie sejam descritas. Muito embora ainda requeria otimização para aumento da expressão, este trabalho contribuirá para que futuros estudos explorem sua atividade biológica, investigando a eficiência quanto à reprodução e melhoria da capacidade reprodutiva em cativeiro do pirarucu. pt_BR
dc.description.sponsorship Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) pt_BR
dc.format.extent 133 pt_BR
dc.rights openAccess pt_BR
dc.subject pituitary hormones
dc.subject organic compounds
dc.subject tsh
dc.subject fishes
dc.subject mammals
dc.subject thyroid hormones
dc.subject endocrine glands
dc.subject disturbances
dc.subject amazon river
dc.subject biochemistry
dc.subject structural models
dc.subject polymerase chain reaction
dc.subject rna polymerases
dc.subject artificial intelligence
dc.subject expert systems
dc.subject detection
dc.title Bioquímica estrutural da tireotrofina de Arapaima gigas e sua expressão em células de mamífero pt_BR
dc.title.alternative Structural biochemistry of Arapaima gigas thyrotropin and its expression in mammalian cells pt_BR
dc.type Dissertação pt_BR
ipen.identifier.ipendoc 29243 pt_BR
sigepi.autor.atividade FREIRE, RENAN P.:14408:810:S pt_BR
dc.coverage N pt_BR
dc.creator.author FREIRE, RENAN P. pt_BR
dc.description.notasgerais Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) pt_BR
dc.description.notastese IPEN/D pt_BR
dc.description.teseinstituicao Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP pt_BR
dc.local São Paulo pt_BR
ipen.autor FREIRE, RENAN P. pt_BR
ipen.date.recebimento 23-01
ipen.meioeletronico https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/85/85131/tde-08112022-105344/pt-br.php pt_BR
ipen.codigoautor 14408 pt_BR
dc.description.sponsorshipID CAPES: 88887.506371/2020-00 pt_BR
dc.identifier.doi 10.11606/D.85.2022.tde-08112022-105344 pt_BR


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Autor: Maprelian

Título: loss of coolant

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Ano de publicação: 2015

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A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

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