INSTITUTO DE PESQUISAS ENERGÉTICAS E NUCLEARES
Repositório Digital da Produção Técnico Científica

Advancing thyroid pathologies detection with recurrent neural networks and micro-FTIR hyperspectral imaging

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dc.contributor.editor ALMEIDA, JOAO R. pt_BR
dc.contributor.editor SPILIOPOULOU, MYRA pt_BR
dc.contributor.editor ANDRADES, JOSE A.B. pt_BR
dc.contributor.editor PLACIDI, GIUSEPPE pt_BR
dc.contributor.editor GONZALEZ, ALEJANDRO R. pt_BR
dc.contributor.editor SICILIA, ROSA pt_BR
dc.contributor.editor KANE, BRIDGET pt_BR
dc.date.accessioned 2024-02-02T11:02:59Z
dc.date.available 2024-02-02T11:02:59Z
dc.identifier.uri http://repositorio.ipen.br/handle/123456789/34444
dc.description.abstract Thyroid disorders are a complex group of diseases that require an accurate diagnosis for effective treatment. Fine-needle aspiration biopsies can assist in detecting many thyroid diseases. These materials can be analyzed visually using traditional computer vision methods, despite the limitations of complex samples. To address this problem, we propose a novel approach that uses hyperspectral imaging (HSI) to analyze thyroid biological samples. HSI measures the absorbance of infrared light by biological samples using a micro Fourier transform infrared spectroscopy (micro-FTIR) and converts this data into hyperspectral images. In this study, we used HSI to train and validate a recurrent neural network to classify thyroid samples as healthy, cancerous, or goiter. Our experiments, based on the k-fold cross-validation, achieved an overall accuracy of 96.88%, a sensitivity of 96.87%, and a specificity of 98.45%. These results demonstrate the potential of hyperspectral imaging as a tool to assist pathologists in the diagnosis of thyroid disease. pt_BR
dc.description.sponsorship Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) pt_BR
dc.description.sponsorship Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) pt_BR
dc.format.extent 611-615 pt_BR
dc.publisher IEEE pt_BR
dc.rights openAccess pt_BR
dc.title Advancing thyroid pathologies detection with recurrent neural networks and micro-FTIR hyperspectral imaging pt_BR
dc.type Texto completo de evento pt_BR
dc.event.sigla CBMS pt_BR
ipen.identifier.ipendoc 30043 pt_BR
sigepi.autor.atividade ZEZELL, DENISE M.:693:920:N pt_BR
dc.coverage I pt_BR
dc.creator.author BAFFA, MATHEUS de F.O. pt_BR
dc.creator.author BACHMANN, LUCIANO pt_BR
dc.creator.author ZEZELL, DENISE M. pt_BR
dc.creator.author PEREIRA, THIAGO M. pt_BR
dc.creator.author DESERNO, THOMAS M. pt_BR
dc.creator.author FELIPE, JOAQUIM C. pt_BR
dc.creator.evento INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON COMPUTER-BASED MEDICAL SYSTEMS, 36th pt_BR
dc.date.evento June 22-24, 2023 pt_BR
dc.local Piscataway, NJ, USA pt_BR
dc.local.evento L’Aquila, Italy pt_BR
ipen.event.datapadronizada 2023 pt_BR
ipen.autor ZEZELL, DENISE M. pt_BR
ipen.date.recebimento 24-02
ipen.notas.internas Proceedings pt_BR
ipen.codigoautor 693 pt_BR
dc.description.sponsorshipID FAPESP: 21/00633-0 pt_BR
dc.description.sponsorshipID CAPES: 88887.498626/2020-00; 88887.695355/2022-00 pt_BR
dc.identifier.doi 10.1109/CBMS58004.2023.00288 pt_BR
dc.identifier.orcid 0000-0001-7404-9606 pt_BR


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Exemplo:

Buscar os artigos apresentados em um evento internacional de 2015, sobre loss of coolant, do autor Maprelian.

Autor: Maprelian

Título: loss of coolant

Tipo de publicação: Texto completo de evento

Ano de publicação: 2015

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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.